В Нидерландах правительство не оспаривает религиозный статус и природу Церкви Саентологии. За многие годы исполнительная власть и суды выпустили многочисленные признания Саентологии религией, а Церкви Саентологии религиозной организацией, предоставляющей религиозные услуги своим прихожанам. Церковь Саентологии зарегистрирована как религиозная организация, а местная саентологическая церковь имеет статус юридического лица.
В Нидерландах министерства выражают своё признание саентологической религии своим обращением с Церковью, её прихожанами и священниками. Например, Министерство юстиции предоставляет саентологическим священникам право посещать тюрьмы, чтобы консультировать и просвещать заключённых; Министерство образования разрешает саентологам создавать собственные школы для обучения детей в соответствии с их религиозными убеждениями; и Налоговая служба принимает статус Саентологии как религии.
В 2007 прихожанка успешно ходатайствовала в суд, чтобы ей разрешили учить своего ребёнка дома, основываясь на своих религиозных убеждениях. Вынося резолюцию, суд полагался на решение Европейского суда по правам человека в деле Церковь Саентологии против Москвы (5 апреля 2007 г., заявление 18147/02). В 1991 году, в соответствии с принципами религиозного равенства и недопустимости дискриминации, налоговый инспектор получил приказ от своих начальников рассматривать декларацию саентологического священника о подоходном налоге так же, как декларации духовенства других религий.