В Хорватии Закон 2002 года о правовом положении религиозных общин широко определяет правовое положение религиозных общин и охватывает такие вопросы, как государственное финансирование, налоговые льготы и религиозное обучение в школах. Регистрация религиозных групп не является обязательной. Однако зарегистрированным группам предоставляется статус «юридического лица», и они получают налоговые льготы и другие преимущества.
Церковь Саентологии Хорватии была официально зарегистрирована как религиозная организация 22 декабря 2003 года в реестре религиозных общин Республики Хорватия. Министерство юстиции не только признало Церковь Саентологии Хорватии, оно также признало Саентологию религией, и в будущем другие саентологические религиозные организации тоже могут быть зарегистрированы.
«Одобрено внесение ЦЕРКВИ САЕНТОЛОГИИ В ХОРВАТИИ… в реестр религиозных общин Республики Хорватия».